学部・研究科等ごとの目的
医薬の創製からその適正使用までを目標とし、生命に関わる物質、及び、その生体との相互作用を対象とする学問体系である。本研究科は薬学の全ての分野において、最高水準の研究活動を行い、これに裏付けられた教育活動により、創薬科学および基礎生命科学の発展に寄与する研究者、医療行政に貢献する人材、高度医療を担う薬剤師の養成を教育・研究の目的とする。
入学者受入方針（アドミッション・ポリシー）
東京大学大学院薬学系研究科修士課程は、学位授与方針（ディプロマ・ポリシー）ならびに教育課程の編成・実施方針（カリキュラム・ポリシー）を踏まえ、有機化学、物理化学、生物化学を機軸に最高水準の教育・研究活動を行い、化学系薬学、物理系薬学、生物系薬学など薬学がカバーすべき広範な分野をリードする優れた創薬科学研究者、基礎生命科学研究者を養成することを目指しています。このような目標のもと、薬学系研究科修士課程では、深い専門性に根ざした薬学的な思考法、論理的で先端的な方法論や分析能力などを身につけることができる人、ならびに高度な知識と研究能力を礎として薬学がカバーすべき広範な基礎及び応用科学の諸分野をリードし、将来にわたり国際的な活躍を目指す人を求めています。
入学者選抜においては、上記の分野に関する基礎的知識、専門的知識及び英語能力が問われ、人物像等を総合して判定します。
教育課程編成・実施方針（カリキュラム・ポリシー）
東京大学大学院薬学系研究科は、研究科の学位授与方針で示した目標を学生が達成できるよう、以下の方針に基づき教育課程を体系的に編成・実施します。
・ ２年以上在学して、薬学系研究科が掲げる教育理念・目標に沿って設定した有機化学、物理化学、生物化学を機軸とする講義科目を履修する。単位認定評価は、学力試験あるいはレポートによりおこなう。
・ 研究室に所属して研究指導を受け、最先端の専門研究の現場において、課題設定能力、研究推進・課題解決能力、国際誌からの情報収集能力、ディスカッション能力、社会性、コミュニケーション能力、成果発信能力などを修得する。
・ 修士論文を執筆、提出し、修士発表等の所定の試験に合格することが修士課程学位授与の要件である。学位授与の認定評価は、主査および副査の指導教員とその他の複数の教員の合議によりおこなう。
学位授与方針（ディプロマ・ポリシー）
東京大学大学院薬学系研究科は、研究科の教育研究上の目的に定める人材を養成するため、次に掲げる目標を達成し、所定の単位を修得し学位論文審査及び試験に合格した学生に修士（薬科学）の学位を授与します。
・ 創薬科学および生命薬学分野の広範でかつ揺るぎない学力の修得
・ 創薬科学および生命薬学分野において、科学的に追及するに値する研究課題を設定できる能力、および研究推進・課題解決能力の涵養
・ 自他の研究を本質的かつグローバルな視点から評価し、建設的に批判・議論できる能力の涵養
・ 豊かな人間性と優れたリーダーシップ、人類全体の公共的な生命の維持や健康の増進に貢献するための責任感、使命感、倫理観の涵養に基づく研究遂行能力の獲得
・ 国際的に情報発信しコミュニケーションをはかるための語学力と国際感覚の修得